Нужно подходить комплексно.
Во первых, скачать какой нибудь антивирус и посмотреть что он выдаст (я чаще пользуюсь drweb для начального тестирования). Бывает что вирусы ставятся в загрузочный сектор, который при переустановке систему может выжить или бывают даже такие которые умудряются поселиться в BIOS на некоторых платах, но это довольно редко, по крайней мере лично не встречал.
Затем (или перед этим) нужно установить какой нибудь персональный firewall (меня вполне устраивает бесплатная версия Agnitum Outpost-
http://www.agnitum.com/download/
) и если переуставлять всё с нуля, то обязательно поставить его до первой же вылазки в интернет, особенно если не используется какой то внешний раутер с NAT и компьютер получает public IP. Иначе, не успев скачать последние патчи уже за несколько минут торчания в интернете можно нацеплять кучу троянов и т.п., особенно если канал шустрый. Если нет возможности использовать раутер или лень ставить filrewall, тогда самое безопасное будет добыть апдейты с сайта использую пропатченную машину и перенести их любыми доступными способами на только установленную операционку и поставить локально.
Ну и обратить внимание на драйверы. Бывает что некоторые с глюками - помню, было давно, одна версия драйвера на видеоадаптер выплёвывала в синий экран в NT 4.0, когда пытался зайти в настройки видеорежима. Причём драйвер шёл на диске в сопровождении с видеокартой. Нашёл потом другую версию, поставил и глюк исчез. И таких примеров много...
А это у него недавно началось или как?
![Smile :)](./images/smilies/icon_smile.gif)