В несколько слоёв не рекомендую, будет варёное. 1-2 кг войдёт на 1 лист легко.
Лучше на 2 противня на разные полки. Если в вашей духовке есть конвекция, то обязательно включить, время готовки уменьшится и на всех полках равномерно запечется.
Только одни цуккини печь не рекомендую, будет не вкусно, добавьте туда перцы, красный лук, пару картошек, морковь мелкую или кружочками.